大陆公司和香港公司做业务增值税征管规则及实操指引
大陆公司和香港公司做业务增值税征管，分别适用内地与香港两地现行生效税收法规，交易场景不同对应纳税义务、申报流程、适用税率存在明显差异，跨境从业者需提前完成合规判定。
两地流转税基础规则对比
| 对比维度 | 内地税制（2026年生效） | 香港税制（截至2026年4月） | 政策来源 |
|---|---|---|---|
| 流转税税种 | 增值税 | 无增值税/消费税类流转税，仅对香港来源经营利润征收利得税 | 内地：财政部 税务总局公告2025年第37号；香港：香港税务局ird.gov.hk2024年10月更新指引 |
| 基础税率/征收率 | 一般纳税人适用13%、9%、6%税率；2025-2026年小规模纳税人适用3%征收率减按1%征收，以官方最新公布为准 | 法团首200万港币应评税利润适用8.25%利得税税率，超出部分适用16.5%税率 | 内地：财政部2025年第37号公告；香港：香港税务局2024年《利得税税率调整公告》 |
| 跨境交易免税适用条件 | 出口货物、完全在境外消费的应税服务符合条件可适用零税率或免税政策 | 利润不属于香港地域来源的跨境交易，无需缴纳利得税 | 内地：国家税务总局2025年跨境应税行为指引；香港：2024年《利得税地域来源判定规则》 |
大陆公司作为销售方向香港公司销售货物的，属于出口货物范畴，符合条件的适用增值税退（免）税政策。大陆公司和香港公司做业务增值税申报流程需按内地税务机关要求执行，具体操作步骤如下：
- 大陆公司完成出口货物报关手续，取得海关出具的出口货物报关单（出口退税专用联），确保货物信息、交易主体信息与合同完全一致。
- 完成对应交易的收汇核销，根据国家外汇管理局2025年11月发布的《经常项目外汇业务指引（2025年版）》，A类信用等级企业可免于提交纸质收汇凭证，直接在线完成核销。
- 在增值税纳税申报期内，向主管税务机关提交退（免）税申报材料，包括出口发票、采购环节进项抵扣凭证、交易合同复印件等。
- 税务机关在10-20个工作日内完成审核，2025-2026年一类出口企业平均办理周期为7个工作日，具体以主管税务机关实际效率为准，符合条件的退税款直接划转至企业对公账户。
未在出口后90天内完成退（免）税申报的交易，视同内销征收增值税，需按对应货物适用税率补缴税款及每日万分之五的滞纳金，该规则来源于财政部 税务总局2025年第37号公告附件2。
大陆公司向香港公司提供完全在境外消费的应税服务，包括研发服务、设计服务、广播影视节目发行服务等，适用增值税零税率政策，其他跨境服务适用免税政策，相关交易合同、境外消费证明材料需留存备查，留存期限为10年。
香港公司作为销售方向大陆公司销售货物的，属于货物进口范畴，由大陆进口方作为扣缴义务人，在货物报关进口时向海关缴纳进口环节增值税，税率与内地同类货物增值税税率一致，已缴纳的进口环节增值税可作为大陆公司的进项税额抵扣。
香港公司向大陆公司提供服务的，若服务购买方为大陆公司且服务不完全在境外消费的，大陆公司作为扣缴义务人，需按适用税率代扣代缴增值税。大陆公司和香港公司做业务增值税代扣代缴所需材料包括服务合同、境外机构的身份证明文件、付款凭证等，申报周期为发生应税行为的次月15日之前。
逾期完成代扣代缴申报的，主管税务机关可依据2024年修正的《中华人民共和国税收征收管理法》第六十二条规定，处2000元以下罚款，情节严重的处2000元以上10000元以下罚款。
实践中存在较多与大陆公司和香港公司做业务增值税相关的认知误区，其中高频误区包括三类。 第一类误区为认为香港公司不需要承担任何流转税税负，实际香港公司本身无本地增值税纳税义务，但向大陆销售货物或服务时，需由大陆购买方履行代扣代缴义务，对应的增值税负可通过交易定价协商承担方。 第二类误区为认为大陆公司与香港公司的所有交易都可享受出口退税政策，实际仅货物实际离境且完成收汇的交易可申请退（免）税，货物流转未离境的视同内销征收增值税。 第三类误区为认为小规模纳税人可申请出口退税，根据2025年第37号公告规定，小规模纳税人出口货物适用免税政策，不予退税，对应的进项税额需计入企业经营成本。
内地与香港已签署《内地和香港特别行政区关于对所得避免双重征税和防止偷漏税的安排》（2025年修订版），符合条件的交易主体可申请税收抵免，避免同一笔所得被两地双重征税。 大陆公司开展合规跨境交易可通过适用出口退（免）税政策降低整体税负，香港公司取得的来源于大陆的交易利润，若未在香港设立常设机构且利润不属于香港地域来源的，无需在香港缴纳利得税，该规则来源于香港税务局2024年10月发布的《跨境交易利得税判定指引》。
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